تعتبر الإدارة العامة للمشاريع والمرافق هي احدى الإدارات التابعة لوكالة الجامعة والتي  تم تأسيسها مع تأسيس الجامعة 1435هـ  وكانت عبارة عن ادارات مستقلة ( ادارة المشاريع -  إدارة التشغيل والصيانة - إدارة الامن والسلامة - إدارة خدمات المرافق ) لشطر الطلاب وشطر طالبات وفي 26/4/1444هـ صدر قرار معالي رئيس الجامعة ان تدمج جميع الادارات وتكون تحت الادارة العامة للمشاريع والمرافق وفق الهيكل التنظيمي المشكل لها 

 وتسعى الإدارة العامة للمشاريع والمرافق أن يكون عملها جزءاً من منظومة التطوير المستمر في الجامعة وتتطلع للمساهمة في تحقيق رؤية المملكة 2030 من خلال دعم صاحب المعالي مدير الجامعة حفظه الله ورؤيته الثاقبة لمستقبل جامعة جدة الزاهر وبدعم سعادة وكيل الجامعة حفظه الله ومتابعته المستمرة وتذليل الصعاب والحث المتواصل على الإنجاز والتميز في الأداء .

مهام الجهة:

• الاشراف على القطاعات التابعة للإدارة وتطبيق أعلى معايير السلامة، والخدمة المجتمعية، وتطوير المدينة الجامعية برؤى مستقبلية، وتحديث وصيانة البنية التحتية، وإدارة المباني بكفاءة وجودة شاملة وزرع بيئة تنظيمية داعمة.  .

• وضع الاستراتيجية ونماذج الإعمال ومؤشرات الأداء والخطط التنفيذية لمجموعة من المرافق والأصول الخاصة بالجامعة .

• رفع تقارير أداء الإدارة والمتعلقة بتشغيل وصيانة شبكة توزيع الكهرباء وشبكة الاتصالات وغيرها من الجوانب المتعلقة بالأعمال والخدمات المقدمة من الإدارة بشكل دوري لتقديم سير الأعمال وتحديد المخاطر المحتملة والتدخل المطلوب.

• تطوير وإدارة الجدول الزمني للمشروع بالتنسيق مع إدارة التخطيط والتأكد من اكتمال المشروع في حدود الميزانية والوقت المحدد.

• الحفاظ على علاقات منسقة مع الإدارات الداخلية، وضمان الامتثال التام للعقد مع المعايير الكاملة لجميع مواصفات الأداء المتفق عليها بموجب العقد.

• متابعة إدارة صيانة وتشغيل العقود التابعة للإدارة (الكهرباء والاتصالات والمشاريع التحسينية وغيرها)، وكذلك الإشراف على أنشطة التجديد ذات الصلة وفق الحاجة.

• إدارة وتحديث ومتابعة مقاييس الأداء لتشمل الجودة الفعالية، رضا المستخدم، كفاءة الانفاق والتطوير المستمر، وغيرها من تقارير قياس الأداء للمرافق والأصول المملوكة.

• الاشراف على اعمال للإدارات التابعة للقطاع .